Im ältesten Institutsgebäude am Hauptstandort Insel Riems, dem Loeffler-Haus, präsentiert das FLI Informationen zu seinem Gründer Friedrich Loeffler als Wissenschaftler und Familienvater sowie zur wechselvollen Geschichte des Instituts. Seit August 2011 öffnet das Loeffler-Haus regelmäßig für interessierte Besucher; aufgrund des begrenzten Raumes ist eine Anmeldung erforderlich.
Kernstück der Ausstellung ist der von Heinrich Drake geschaffene bronzene Portraitkopf des Institutsgründers. Handschriftliche Aufzeichnungen, wissenschaftliche Arbeiten, Gegenstände aus seinem Privatleben und von professionellen Sprechern eingespielte Schilderungen von Zeitzeugen geben Einblicke in das Leben und Wirken Friedrich Loefflers.
Die wechselvolle Geschichte des Instituts wird in Texttafeln, Arbeitsgegenständen aus dem Laboralltag, Foto- und Filmmaterial gezeigt. Beispiele für erfolgreiche Tierseuchenbekämpfung und Meilensteine der Forschungen des Instituts geben Karten in einer Informationswand wieder, in der darüber hinaus auch Gegenstände und Filme aus dem Inselleben gezeigt werden. Ein Zeitstrahl gibt einen Überblick über die Entwicklung der Insel, Baumaßnahmen, Wissenschaft und Forschung sowie Kunstobjekte. Schiebetafeln zeigen die bauliche Entwicklung der Insel Riems.
Die Ausstellung wurde anlässlich des 100-jährigen Gründungsjubiläums erstellt und erstmals am Jubiläumstag, dem 10. Oktober 2010, präsentiert. Als Kuratorin wirkte die Kulturwissenschaftlerin Sabine Steffens, die Ausstellungsgestaltung übernahm G4 grafikdesign Bräuer und Hornung aus Rostock.