Institute des Friedrich-Loeffler-Instituts
- Institut für bakterielle Infektionen und Zoonosen
- Institut für Epidemiologie
- Institut für Immunologie
- Institut für Infektionsmedizin
- Institut für Molekularbiologie
- Institut für Molekulare Pathogenese
- Institut für neue und neuartige Tierseuchenerreger
- Institut für Nutztiergenetik
- Institut für Tierernährung
- Institut für Tierschutz und Tierhaltung
- Institut für Virusdiagnostik